Liderzy Wspólnoty „Nowe Jeruzalem” stanowią Radę Wspólnoty, która składa się z 3 członków, wybranych przez członków Kolegium Odpowiedzialnych, ze swojego grona.
Rada Wspólnoty wybiera spośród siebie głównego Lidera – Moderatora, którym będzie mężczyzna.
Obecnie (od grudnia 2023 roku) funkcję liderów Wspólnoty „Nowe Jeruzalem” pełnią
Małgorzata Bułat – Moderator
Teodora Woyciechowska-Wawrzyk
Angelika Kolasa